谐波保护器和有源滤波器都是用于解决电力系统中的谐波问题的设备，但它们之间存在一些区别。谐波保护器主要针对用电设备产生的随机高次谐波、脉冲尖峰、电涌等进行抑制和吸收，而有源滤波器则可以对频率和幅度都变化的谐波进行治理。有源滤波器通过CT采集系统谐波电流，经控制器快速计算并提取各次谐波电流的含量，产生谐波电流指令，通过功率执行器件产生与谐波电流幅值相等方向相反的补偿电流，以抵消非线性负载所产生的谐波电流。而谐波保护器则利用其滤波器和电涌保护器的功能，对电压尖峰杂波、畸变的电压波形、谐波噪声进行消化和吸收，防止保护装置误跳闸，保证用电设备正常运行。